中医农业投入品来源于纯天然物质，无任何人工化学合成物质，符合有机农业投入品要求，因此，中医农业可以像芯片一样插入有机农业体系，在显著减少有机农产品生产成本的基础上还能增加产量，让有机农业突破高成本低产量的瓶颈。此外，经过几十种风味指标检测，中医农业的产品口感普遍优于有机农产品，这也是中医农业超越有机农业的重要方面。最重要的是，中医农业能在不增加生产成本的基础上有效促进常规农业生产摆脱化学农业带来的农产品农残的困扰，即使在污染耕地上，经过多季种植和土壤修复（平衡酸碱度，分解化学物质残留，钝化重金属，增强有机质积累），也可以让农产品达到有机农产品的质量安全标准。

 

　　中医农业投入品在种植业方面不仅有土壤拌施剂、根部冲施剂，还有叶面喷施剂和一些针对盐碱地、酸化地和重金属污染的特殊用途修复剂；在养殖方面中草药兽药和饲料助剂不仅能替代各种抗生素、激素的使用，还能预防各种疾病。

 

　　在经过中医农业修复的具有良好活性的土壤生态环境中，农作物的根部能有效全面地吸收营养，健康地生长，土壤也能提供全面的营养，最终能生产出营养全面的植物性产品。营养全面的植物性产品在满足人的健康生长需求的同时，又能通过饲料满足动物健康生长的需求，进一步为人体提供了营养全面的动物性产品。这样，从食物的角度，人体得到了基本的健康保障。

 

　　中医农业投入品有利于快速恢复土壤中被化学农业投入品抑制的土著微生物活性。土壤中对农作物有利的有益菌群很多，例如，枯草芽孢杆菌能增加作物抗逆性、固氮；巨大芽孢杆菌能解磷（磷细菌），具有很好的降解土壤中有机磷的功效；胶冻样芽孢杆菌能解钾，释放出可溶磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素；地衣芽孢杆菌能抗病、杀灭有害菌；苏云金芽孢杆菌能杀虫（包括根结线虫），对鳞翅目等节肢动物有特异性的毒杀活性；侧孢芽孢杆菌能促根、杀菌及降解重金属；胶质芽孢杆菌：有溶磷、释钾和固氮功能，分泌多种酶，增强作物对一些病害的抵抗力；泾阳链霉菌能具有增强土壤肥力、刺激作物生长的能力；菌根真菌能扩大根系吸收面，增加对原根毛吸收范围外的元素（特别是磷）的吸收能力；棕色固氮菌能固定空气中的游离氮，增产；光合菌群是肥沃土壤和促进动植物生长的主力部队；凝结芽孢杆菌可降低环境中的氨气、硫化氢等有害气体；提高果实中氨基酸的含量；米曲霉使秸秆中的有机质成为作物生长所需的营养，提高土壤有机质，改善土壤结构；淡紫拟青霉对多种线虫都有防治效能，是防治根结线虫最有前途的生防制剂。此外，中药肥还有利于多种复合菌相互促进、相互补充、相互协同，这样的共同作用效果远远大于单一菌种。